Ο Μάρλιν, ένα ψάρι κλόουν, και ο γιος του, ο Νέμο, ζούσαν μια ήσυχη ζωή στο Μεγάλο Κοραλλιογενές Φράγμα, ώσπου μια μέρα ο Νέμο απομακρύνθηκε αρκετά και αιχμαλωτίστηκε από έναν δύτη! Χωρίς να χάσει καιρό, και παρά τον φόβο του για τον μεγάλο ωκεανό, ο υπερπροστατευτικός Μάρλιν ξεκινά, παρέα με την Ντόρη, ένα ψάρι με μεγάλη καρδιά, αλλά με αδύναμη μνήμη, να αναζητήσει τον γιο του. Πού κατοικούν τα ψάρια κλόουν, όπως είναι ο Νέμο και ο Μάρλιν, και τι…